iTunes v 7.7.0.43
прошивка iPod shuffle v1.0.4

При воспроизведении того трека в библиотеке (или в ином другом плейлисте)  который есть и в библиотеке и в плеере, запускается синхронизация шафла, вылетает автозапуск (виндовсовское окно со внутренностями флешки-шафла).

То же самое происходит при изменении рейтинга этого трека. Т.е на шафле обнавляются показатели рейтинга и дат последнего прослушивания (хотя эти данные мне не нужны на шафле и впринципе в общей структуре библиотеки).

По завершении синхронизации съемный диск исчезает.

Вот это все и тормозит iTunes и систему.
Автоматическая синхронизацию убрана (Правка - настройки - Синхронизация - Отключить автоматическую синхронизацию для всех iPhone и iPod)

Как избавится от этого, или как сделать так, чтобы на плеере не обнавлялись данные о рейтинге и датах прослушивания или обнавлялись по выбору пользователя.

У iPod shuffle нет полноценной ручной синхронизации с iTunes - треки можно перетаскивать мышкой, но уже имеющаяся медиатека iPod’а всё равно синхронизируется, причём и треки, которых уже нет в медиатеке iTunes, автоматически удаляются из iPod’а. Такова особенность iPod shuffle.

Спасибо. Значит из-за неполноценной ручной синхронизации нельзя использовать Shuffle на 2х разных библиотеках iTunes?
А можно сделать так, что бы  iTunes не убивал  mp3, закаченные сторонним ПО?

Тогда уж лучше используй для своего shuffle стороннюю программу.